TruSight Tumor 15
TruSight Tumor 15
Оценка 15 генов, которые обычно мутируют в солидных опухолях, в одной панеле с простым и быстрым рабочим процессом.
TruSight Tumor 15 использует технологию секвенирования следующего поколения (NGS) для комплексной оценки 15 генов, которые обычно мутируют в солидных опухолях. Он достоверно обнаруживает редко встречающиеся варианты из 20 нг исходной ДНК и оптимизирован для работы с FFPE образцами опухолевых тканей.
Преимущества TruSight Tumor 15:
Панель позволяет разом оценить 15 генов вместо отдельной оценки каждого гена с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР).
Всего 3,5 часа работы непосредственно руками (от ДНК до получения данных примерно 36 часов).
Соматические варианты, включённые в панель, выбраны в соответствии с актуальными гайдами, данными экспертов и фармацевтических исследований.
Высокочувствительное обнаружение вариантов при низком количестве стартового ДНК: достоверное определение соматического варианта с частотой аллеля 5% из 20 нг ДНК из FFPE образцов ткани.
TruSight Tumor 15: данные по образцам
3 референсных человеческих образца и 5 FFPE образцов ДНК из опухолей легких, толстой кишки, меланомы и молочной железы были приготовлены с использованием TruSight Tumor 15. Эти библиотеки были секвенированы на системе MiniSeq с использованием high output kit с длиной прочтения 2 x 150 п.о. с двойной индексацией. Общий выход составил 7,6 Gb с 94,9% оснований на уровне Q30 или выше.
Спецификации
Время анализа |
7 часов |
---|---|
Время непосредственно ручной работы |
3,5 часа |
Количество стартового материала | 20 нг |
Тип рака | Солидная Опухоль |
Описание | Панель для изучения соматических вариантов солидных опухолей в 15 генах, с простым рабочим процессом. |
Особенности содержимого | Амплифицирует 250 ампликонов из 15 генов, связанных с солидными опухолями |
Мультиплексирование | 1-24-plex |
Для работы с какими платформами подходит | MiniSeq, MiSeq, MiSeqDx (в исследовательском режиме) |
Класс вариантов |
Инделы, Соматические варианты |
Тип нуклеиновой кислоты | ДНК |
Специализированные типы образцов |
FFPE-ткани |
Метод |
Amplicon Sequencing, Targeted DNA Sequencing |
Для исследования каких видов подходит |
Человек |
Технология | Секвенирование |
Рекомендации по проекту
Список включённых в TruSight Tumor 15 генов
AKT1 | GNA11 | NRAS |
BRAF | GNAQ | PDGFRA |
EGFR | KIT | PIK3CA |
ERBB2 | KRAS | RET |
FOXL2 | MET | TP53 |