AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3
AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3
Панель AmpliSeq for Illumina Comprehensive Panel v3 направлена на изучение основных раковых генов, включая киназные домены и гены, участвующие в репарации ДНК. Основные характеристики:
Содержимое набора
Панель направлена на изучение 161 гена, связанного с раком.
Быстрый, оптимизированный рабочий процесс
Подготовка библиотеки для секвенирования всего за один день из всего 1 нг стартового материала высокого качества или 10 нг образца FFPE
Точные данные
Определение соматических мутаций as low as 5% variant allele frequency using local or cloud based analysis
Comprehensive Panel v3 является частью общего рабочего процесса, который включает в себя подготовку библиотек по технологии AmpliSeq для Illumina, основанную на полимеразной цепной реакции (ПЦР), секвенирование нового поколения Illumina по технологии sequencing by synthesis (SBS), и автоматизированный анализ.
Эта панель охватывает хотспоты, полные гены, copy number genes и меж- и внутригенные фьюжены. Эта ready-to-use панель экономит исследователям время и усилия по определению таргетов, разработке праймеров и оптимизации панелей.
Спецификации
Число ампликонов |
всего 4648. 4 пула (Пул ДНК 1: 1891 ампликонов. Пул ДНК 2: 1890 ампликонов. Пул РНК 1: 447 ампликонов. Пул РНК 2: 420 ампликонов.) |
---|---|
Время анализа |
5-6 часов (время включает в себя только подготовку библиотеки и не включает в себя определения качества библиотеки, нормализацию или пулирование) |
Время ручного труда |
<1,5 часа |
Тип нуклеиновой кислоты | ДНК, РНК |
Количество стартового материала | 1–100 нг (рекомендуется 10 нг на пул) |
Особенности содержимого |
таргеты ДНК и РНК для 163 онкогенов |
Multiplexing | 96 dual index combinations |
Механизм действия | Мультиплексная ПЦР |
Для исследования каких видов подходит |
Человек |
Метод |
Amplicon Sequencing, Targeted DNA Sequencing, Targeted RNA Sequencing |
Класс вариаций |
Copy Number Variants (CNVs), Gene Fusions, Insertions-Deletions (indels), Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs), Somatic Variants |
Для работы с какими платформами подходит |
NextSeq 550, NextSeq 550Dx (в исследовательском режиме) |
Специальные типы образцов | кровь, FFPE |
Технология | Секвенирование |