AmpliSeq for Illumina Custom RNA Panel
AmpliSeq for Illumina Custom RNA Panel - кастомная таргетная панель, разработанная для секвенирования 1200 таргетных участков генома.
AmpliSeq for Illumina Custom RNA Panel
Кастомная таргетная панель, разработанная для секвенирования 1200 таргетных участков генома.
Используйте AmpliSeq for Illumina Custom RNA Panel для измерения экспрессии генов в 12 - 1200 таргетных участках генома. Вы можете легко создавать собственные таргетные панели из более чем 20 000 человеческих генов RefSeq, используя ПО DesignStudio, веб-инструмент для разработки панелей. Ключевые особенности включают в себя:
Быстрое профилирование экспрессии генов
Подготовка библиотек занимает 6 часов (время непосредственной работы руками <1,5 часов);
Работа даже с малым количеством стартового материала образцов с низким качеством
Набор позволяет получить высококачественные данные даже при очень малом количестве стартового материала из тканей FFPE.
Комплексный рабочий процесс от ДНК до анализа
Воспользуйтесь преимуществами комплексного рабочего процесса, охватывающего подготовку библиотек, секвенирование и анализ данных.
Спецификации
| Класс вариаций |
Transcript Variants |
|---|---|
| Тип нуклеиновой кислоты | РНК |
| Для работы с какими платформами подходит | iSeq 100, MiniSeq, MiSeq, NextSeq 500, NextSeq 550 |
| Специализированные типы образцов | Кровь, ткань FFPE |
| Метод | Amplicon Sequencing, Custom Sequencing, Targeted RNA Sequencing |
| Для исследования каких видов подходит |
Человек |
| Технология | Секвенирование |
Сравнение наборов
|
AmpliSeq for Illumina Custom RNA Panel |
TruSeq Targeted RNA Expression Library Prep Kits |
|
| Тип нуклеиновой кислоты |
РНК |
РНК |
| Для работы с какими платформами подходит |
iSeq 100, MiniSeq, MiSeq, NextSeq 500, NextSeq 550 |
MiniSeq, MiSeq, NextSeq 500, NextSeq 550 |
|
Для исследования каких видов подходит |
Человек |
Человек, Мышь, Крыса |
| Метод |
Amplicon Sequencing , Custom Sequencing, Targeted RNA Sequencing |
Targeted RNA Sequencing |
| Специальные типы образцов |
Кровь, ткань FFPE |
ткань FFPE, малое количество стартового материала |
Высокая согласованность между копиями
Библиотеки готовили из 10 нг человеческой РНК с использованием AmpliSeq for Illumina Custom RNA Panel (размер панели - 208 ампликонов) и секвенировали на системе MiSeq. Результаты показывают высокую согласованность (R2 = 0,997) между двумя копиями одного и того же образца РНК. R2 - статистическое измерение корреляции данных.
Высокое выравнивание чтений
AmpliSeq for Illumina Custom RNA Panel позволяет исследователям анализировать дифференциальную экспрессию генов по интересующим генам. Для демонстрации эффективности панели РНК человеческого мозга и человеческую РНК анализировали с использованием 5 панелей AmpliSeq for Illumina Custom RNA различных размеров (с разным количеством ампликонов). Библиотеки были секвенированы на системе MiSeq.
библиотек с помощью: