AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel
AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel
Таргетная панель для изучения 40 генов ДНК, 29 генов-драйверов фьюженов РНК и 5 генов уровней экспрессии, связанных с миелоидным раком. Myeloid Panel позволяет одновременно анализировать ДНК и РНК из образцов крови и костного мозга для изучения биомаркеров, связанных с гематологическими злокачественными новообразованиями. Панель охватывает соответствующие таргеты для этих основных миелоидных патологий: острый миелоидный лейкоз (ОМЛ), миелоидный диспластический синдром (МДС), миелопролиферативные новообразования (МПН), хронический миелоидный лейкоз (ХМЛ), хронический миеломоноцитарный лейкоз (ЦММЛ) и ювенильный миеломоноцитарный лейкоз (ЮМЛ).
Высококлассное содержимое
Нацеленность на биомаркеры по 69 генам, включая сложные таргеты, такие как CEBPA и FLT3-ITD.
Быстрый, оптимизированный рабочий процесс
Подготовьте готовые к секвенированию библиотеки за один день всего из 10 нг высококачественной ДНК и РНК.
Точные данные
Определение соматических мутаций с частотой до 5% с помощью локального или облачного анализа.
Панель AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel является частью общего рабочего процесса, который включает в себя подготовку библиотеки по технологии AmpliSeq для Illumina, основанную на полимеразной цепной реакции (ПЦР), секвенирование нового поколения Illumina по технологии sequencing by synthesis (SBS), и автоматизированный анализ.
Эта готовая к использованию панель экономит Ваше время и усилия, связанные с определением таргетов, разработкой праймеров и оптимизацией панелей.
Спецификации
Время анализа |
5.5 – 7.5 часов (время включает в себя только подготовку библиотеки и не включает в себя определения качества библиотеки, нормализацию или пулирование) |
---|---|
Время работы руками |
<1,5 часа |
Тип нуклеиновой кислоты | РНК, ДНК |
Количество стартового материала |
20 нг ДНК высокого качества, 10 нг РНК высокого качества (рекомендуется 10 нг на пул) |
Особенности содержимого |
Нацеленность на биомаркеры по 69 генам (40 ключевых генов-мишеней ДНК, 29 генов-драйверов фьюженов РНК и 5 генов уровней экспрессии) |
Описание | Таргетная панель для изучения 40 генов ДНК, 29 генов-драйверов фьюженов РНК и 5 генов уровней экспрессии, связанных с миелоидным раком |
Multiplexing | до 96-plex |
Для исследования каких видов подходит |
Человек |
Метод |
Amplicon Sequencing, Targeted DNA Sequencing, Targeted RNA Sequencing |
Класс вариаций | Gene Fusions, Insertions-Deletions (indels), Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs), Somatic Variants |
Для работы с какими платформами подходит |
MiniSeq, MiSeq |
Специальные типы образцов | ткани FFPE, кровь, образцы в малом количестве |
Типы рака | Гематологические |
Технология | Секвенирование |
Рекомендации по работе
Инструмент |
Рекомендуемое количество образцов | Длина прочтения |
---|---|---|
MiniSeq System |
Количество образцов за запуск (mid output): 4 ДНК, 32 РНК, 3 комбинированных образца (на основе> 95% при минимальном охвате в 500 раз) (high output): 12 ДНК, 96 РНК, 11 комбинированных образца (на основе> 95% при минимальном охвате в 500 раз) |
2 × 151 п.о. |
MiSeq System |
Количество образцов за запуск: реагенты v2: 7 ДНК, 60 РНК, 6 комбинированных образцов реагенты v3: 7 ДНК, 60 РНК, 6 комбинированных образцов |
2 × 151 п.о. |
Сравнение наборов
AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel | AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 | TruSight Myeloid Sequencing Panel | |
Время анализа |
5.5 – 7.5 часов (время включает в себя только подготовку библиотеки и не включает в себя определения качества библиотеки, нормализацию или пулирование) | 5 часов (время включает в себя только подготовку библиотеки и не включает в себя определения качества библиотеки, нормализацию или пулирование) | 8 часов |
---|---|---|---|
Время работы руками |
<1,5 часа | <1,5 часа | 3 часа |
Тип нуклеиновой кислоты | РНК, ДНК |
ДНК |
ДНК |
Количество стартового материала |
20 нг ДНК высокого качества, 10 нг РНК высокого качества (рекомендуется 10 нг на пул) |
1–100 нг (рекомендуется 10 нг на пул) | 50 нг |
Особенности содержимого |
Нацеленность на биомаркеры по 69 генам (40 ключевых генов-мишеней ДНК, 29 генов-драйверов фьюженов РНК и 5 генов уровней экспрессии) |
Хотспоты 50 генов с известными ассоциациями с раком | Нацеленность на 54 гена, связанных с миелоидными злокачественными новообразованиями. Зонды амплифицируют 568 ампликонов из генов-супрессоров опухолей и хотспотов мутаций. |
Описание | Таргетная панель для изучения 40 генов ДНК, 29 генов-драйверов фьюженов РНК и 5 генов уровней экспрессии, связанных с миелоидным раком | Соматический анализ хотспотов 50 генов, связанных с раком. | Для изучения соматических мутаций миелоидных злокачественных новообразований. |
Multiplexing | до 96-plex | 96 dual index combinations | до 96-plex |
Для исследования каких видов подходит |
Человек |
Человек |
Человек |
Метод |
Amplicon Sequencing, Targeted DNA Sequencing, Targeted RNA Sequencing |
Amplicon Sequencing, Targeted DNA Sequencing |
Amplicon Sequencing, Targeted DNA Sequencing |
Специальные типы образцов | ткани FFPE, кровь, образцы в малом количестве |
ткани FFPE, кровь |
Не совместим с FFPE |
Высокий охват гена CEBPA
ДНК, оцененная с помощью AmpliSeq for Illumina Myeloid Panel, показывает высокую глубину покрытия по всему транскрипту гена.
библиотек с помощью: