TruSight Oncology 500 High-Throughput
TruSight Oncology 500 High-Throughput - набор для комплексного геномного профилирования из образцов FFPE, вмещающий до 192 образцов на проточную ячейку.
TruSight Oncology 500 High-Throughput
Набор для комплексного геномного профилирования из образцов FFPE, позволяющий загрузить до 192 образцов на проточную ячейку.
TruSight Oncology 500 High-Throughput основан на наборе TruSIght Oncology 500, но имеет большую пропускную способность и различные варианты комплектации.
Объединённый анализ
-
Экономия времени, денег и образцов благодаря объединению нескольких тестов. Эта панель позволяет проанализировать 523 гена и оценить ключевые биомаркеры, присутствующие в гайдлайнах и клинических испытаниях, а также MSI и TMB как в ДНК, так и в РНК*.
Высокая пропускная способность
-
Возможно запускать от 16 до 192 образцов на каждой проточной ячейке на NovaSeq 6000.
С акцентом на будущее
-
Панель содержит как известные, так и новые биомаркеры для исследований в области онкологии.
Надежные результаты
-
TruSight Oncology 500 соответствуют строгим аналитическим характеристикам производительности и обеспечивает надежные, воспроизводимые результаты.
-
Внутрилабораторное решение, дающее множество преимуществ Имеется возможность предлагать комплексные услуги по геномному профилированию местному онкологическому сообществу локально,не отдаваяценные образцы и данные в сторонние организации.
* Основано на базе клинических знаний PierianDx, по состоянию на март 2020 г.
Спецификации
Количество генов | 523 гена для ДНК, 55 генов для РНК |
---|---|
Время анализа |
4-5 дней от образца до результата |
Время работы руками |
~ 10,5 часов |
Тип нуклеиновой кислоты | РНК, ДНК |
Пропускная способность |
16-192 образцов на проточную ячейку |
Аналитическая специфичность | 99,9998% (при обнаружении SNV) |
Аналитическая чувствительность | > 96% |
Количество стартового материала |
40 нг ДНК, 40 нг РНК |
Особенности содержимого |
Таргетные участки ДНК из 523 генов, представляющих интерес, и РНК из 55 генов, при общем размере панели 1,94 Mb. • Охват гайдлайнов: широкий охват ключевых гайдлайнов по множественным типам солидных опухолей. • Охват клинических испытаний: более 1000 клинических испытаний. • Охват иммуно-онкологических биомаркеров: охват биомаркеров MSI, а также появляющихся биомаркеров TMB, POLE1 и POLD1. |
Мультиплексирование |
192 индекса IDT for illumina Nextera DNA UD (ДНК и РНК) |
Механизм действия |
Рабочий процесс, основанный на гибридном захвате ДНК и РНК |
Для исследования каких видов подходит |
Человек |
Тип рака |
Пан-раковый анализ |
Метод |
Таргетное обогащение, Таргетное ДНК секвенирование, Таргетное РНК секвенирование |
Класс вариантов |
Варианты числа копий (CNV), фьюжены генов, инсерции и делеции (инделы), однонуклеотидные варианты (SNV), варианты транскриптов |
Для работы с какими платформами подходит | NovaSeq 6000 |
Особые типы образцов | ткани FFPE |
Технология | Секвенирование |
Возможность автоматизации | Автоматические станции пипетирования |
Серия TruSight Oncology 500
Продукты серии TruSight Oncology 500 позволяют проводить комплексное геномное профилирование (CGP) на основе биопсии крови и тканей, взятой в домашних условиях. Все три набора в серии предназначены для определения ключевых биомаркеров в гайдлайнах и клинических испытаниях.
TruSight Oncology 500 Assay
Оценка ключевых биомаркеров рака из опухолевой ткани FFPE.
TruSight Oncology 500 High-Throughput Assay
До 192 образцов одновременно, используя те же биомаркеры и тип ткани, что и TruSight Oncology 500.
TruSight Oncology 500 ctDNA Assay
Анализ свободноциркулирующей опухолевой ДНК из плазмы.
Преимущества серии продуктов TruSight Oncology 500
Детальное геномное профилирование
Оценка всех ключевых биомаркеров в гайдлайнах, а также в клинических испытаниях, увеличивает шансы найти положительный биомаркер для каждого образца. Включая все ключевые варианты генома, а также иммуно-онкологические биомаркеры MSI и TMB, панели позволяют лаборатории объединить несколько независимых анализов и рабочих процессов в один, одновременно экономя образцы, время и деньги.
Самостоятельное выполнение анализа
Самостоятельное выполнение анализа позволяет держать образцы и данные под контролем. Благодаря содержанию, включающему в себя как новые, так и уже известные биомаркеры, а также благодаря исследованиям IVD центров в сотрудничестве с несколькими фармацевтическими компаниями, эти анализы предназначены для того, чтобы служить в лаборатории ключевым инструментарием в течение длительного времени.
Интегрированный, универсальный и адаптируемый рабочий процесс
Оценка всех биомаркеров в едином интегрированном 4-5-дневном рабочем процессе, включающем решения для анализа данных вплоть до полного окончательного отчета и интерпретации. Возможность комплексного геномного профилирования на основе образцов твердой или жидкой биопсии при различных количествах образцов.
Надежные результаты
Аналитическая специфичность - 99,999% и аналитическая чувствительность > 95% благодаря надежной химии гибридного захвата, секвенированию методом SBS и тщательно продуманной биоинформатике.
Сравнение наборов
TruSight Oncology 500 | TruSight Oncology 500 High-Throughput |
TruSight Oncology 500 ctDNA |
|
---|---|---|---|
Тип образцов | FFPE (ДНК и РНК) | FFPE (ДНК и РНК) | Плазма ( сцДНК) |
Количество генов |
523 гена, относящихся к раку, из ДНК – для анализа SNV, инсерций и делеций (indels); 55 генов из РНК – для анализа фьюженов и вариантов сплайсинга |
523 гена, относящихся к раку, из ДНК – для анализа SNV, инсерций и делеций (indels); 55 генов из РНК – для анализа фьюженов и вариантов сплайсинга | 523 гена, относящихся к раку, из ДНК - для анализа SNV, инсерций и делеций (indels) |
Гены, позволяющие обнаружить CNV | 59 генов | 59 генов | 59 генов |
Фьюжены | 55 генов | 55 генов | 23 гена |
Локусы MSI | 130 локусов | 130 локусов | 76 локусов |
Покрытие секвенирования | 3500х |
3500х |
35000х |
Размер панели |
1.94 Mb ДНК 358 kb РНК |
1.94 Mb ДНК 358 kb РНК |
1.94 Mb ДНК |
Для работы с какими платформами подходит |
NextSeq 550Dx (в исследовательском режиме) NextSeq 500/550 |
NovaSeq 6000 | NovaSeq 6000 |
Производительность |
NextSeq - 8 образцов |
NovaSeq SP - 16 образцов NovaSeq S1 - 32 образцов NovaSeq S2 - 72 образца NovaSeq S4 - 192 образца |
NovaSeq S2 - 8 образцов NovaSeq S4 - 24 образца |
Возможность индексирования |
16 индексов UD TruSight (ДНК и РНК) |
192 индекса IDT for illumina Nextera DNA UD (ДНК и РНК) | 16 индексов UD TruSight (ДНК) |
Количество стартового материала |
40 нг ДНК 40 нг РНК |
40 нг ДНК 40-80 нг РНК |
30 нг сцДНК |
Специфичность ((при обнаружении SNV) |
99.9998% |
99.9998% | 99.9995% |
Чувствительность |
>96% |
>96% | >95% |
библиотек для:
TruSight Oncology 500 Local App: Docker-based Software
Interpret & Report
PierianDx Clinical Genomics Workspace Software