Nextera DNA Flex Library Prep KitВЕРНУТЬСЯ НАЗАД

Nextera DNA Flex Library Prep Kit

Быстрый рабочий процесс для целого комплекса применений: для секвенирования и полного генома человека, и ампликонов, плазмид. микробов и др.

Nextera DNA Flex Library Prep Kit является универсальным набором для полногеномного секвенирования различных организмов.

  • Самая быстрая подготовка библиотек среди наборов Illumina (общее время ~ 3,5 часа)

  • Универсальный набор - подходит для различных типов образцов, количества стартового материала и областей применения


  • Оптимизированная производительность подготовки библиотеки, обеспечивающая надежные результаты

Экономьте время и ресурсы

Протокол Nextera DNA Flex Library Prep Kit быстрый и простой для понимания. Химия тагментации на шариках сокращает общее время подготовки библиотеки до ~ 3,5 часов, от выделения ДНК до нормализации библиотеки.

Упростите работу в лаборатории 

Nextera DNA Flex подходит для работы с широким диапазоном количества стартового ДНК (1–500 нг), с различными типами образцов, как для малых, так и больших геномов. Рабочий процесс включает извлечение ДНК из крови, слюны или высушеных пятен крови или бактериальных колоний. Данный набор универсален и подходит как для секвенирования генома человека или других больших, сложных геномов, так и ампликонов или микробов.

Получите достоверные результаты 

Принимая во внимание всевозможные запросы и требования различных исследований, Nextera DNA Flex обеспечивает предсказуемый размер вставок, равномерное покрытие и оптимизированную производительность независимо от количества вводимой ДНК или размера генома. Технология, основанная на микро-шариках, сводит к минимуму расхождения и вероятность ошибок, что приводит к получению высоко воспроизводимых данных на всех системах секвенирования Illumina.

Универсальные параметры пропускной способности

24 CD индекса поставляются в пробирках, а 96 - в планшете.

Набор индексов IDT® для Illumina®-Nextera ™ DNA UD - это новейший набор индексов, предлагающий до 96 уникальных двойных индексов для точного распределения прочтений и эффективного использования проточной ячейки.

В наборе индексов IDT® для Illumina® - Nextera ™ DNA UD - используются индексы из 10 пар оснований. Это требует внесения изменений в установки запуска сиквенса. Дополнительную информацию смотрите на странице техподдержки индексов Nextera DNA UD indexes.

Спецификации

Время анализа
~ 3-4 часа от выделения ДНК до нормализованной библиотеки
Время непосредственно ручной работы
1-1,5 часа
Тип нуклеиновой кислоты  ДНК
Количество стартового материала Малые геномы (например, микробы): 1-500 нг ДНК. 
Большие геномы (например, человека): 100-500 нг ДНК.
Описание Быстрый, универсальный рабочий процесс для целого комплекса исследовательских применений и типов образцов: подходит для полногеномного секвенирования и микробов, и человека; и многого другого.
Мультиплексирование до 96 доступных уникальных двойных индексов
Механизм действия bead-linked transposome
Для исследования каких видов подходит
Любые виды, человек, мышь, крыса, растение, дрозофила, вирус, дрожжи, данио, бактерии, млекопитающее, нематода
Таргетный размер вставки ~500 п.о.
Метод Секвенирование ампликоновDe Novo секвенированиеShotgun секвенированиеПолногеномное секвенирование
Класс вариаций Хромосомные аномалии, Варианты числа копий (CNV), Фьюжены генов, Герминальные варианты, Инделы (вставки-делеции), Потеря гетерозиготности (LOH), Однонуклеотидный полиморфизм (SNP), Соматические варианты, Structural Variants, Структурные варианты
Для работы с какими платформами подходит HiSeq 2500, HiSeq 3000, HiSeq 4000, HiSeq X Five, HiSeq X Ten, iSeq 100, MiniSeq, MiSeq, MiSeq Dx (в исследовательском режиме), NextSeq 500, NextSeq 550, NextSeq 550Dx (в исследовательском режиме), NovaSeq 6000
 Специальные типы образцов Кровь, несовместимые с FFPE, слюна
     Особенности в зависимости от типа образца Поддерживает несколько типов образцов, включая геномную ДНК, кровь (включая высушеные пятна крови), слюну, ампликоны ПЦР, плазмиды и бактериальные колонии 
Технология Секвенирование 
Возможность автоматизации Автоматические станции пипетирования

Рекомендации по проекту

Секвенатор
Рекомендуемое количество образцов
Длина прочтения 
NextSeq 550
1 образец за запуск (high output; на основе 30-кратного покрытия генома человека) до 2 х 150 п.о.
HiSeq 2500
2–10 образцов за запуск  (двухпотоковая ячейка; на основе 30-кратного покрытия генома человека)
до 2 х 125 п.о. (rapid run) 
до 2 × 150 п.о. (high output)

Сравнение наборов

       Nextera DNA Flex Library Prep Kit
TruSeq DNA PCR-Free TruSeq DNA Nano 
Время анализа
~ 3-4 часа (от выделения ДНК до нормализованной библиотеки) 5 часов -  общее время анализа ~6 часов -  общее время анализа
 Время непосредственно ручной работы  1-1,5 часа 4 часа ~4 часа
Количество стартового материала Малые геномы (например, микробы): 1-500 нг ДНК.
Большие геномы (например, человека): 100-500 нг ДНК.
1 мкг ДНК     100 нг геномной ДНК
Описание Быстрый, универсальный рабочий процесс для целого комплекса исследовательских применений и типов образцов: подходит для полногеномного секвенирования и микробов, и человека; и многого другого.
Простая  PCR-free пробоподготовка для полногеномного секвенирования с возможностью секвенировать сложные участки генома. Набор для работы с малым количеством стартового материала, который обеспечивает высокое качество покрытия генома и снижает ошибки.
Механизм действия bead-linked transposome
Механическая фрагментация ДНК и лигирование адаптеров. PCR-free. Gel-free. Механическая фрагментация ДНК и лигирование адаптеров. Reduced-bias PCR. Gel-free.
Мультиплексирование до 96 доступных уникальных двойных индексов до 24 одиночных, 96 комбинаторных (CD) двойных, 24 уникальных двойных и 96 уникальных двойных (UD) комбинаций (скоро будет доступно) до 24 одиночных, 96 комбинаторных (CD) двойных, 24 уникальных двойных и 96 уникальных двойных (UD) комбинаций (скоро будет доступно)
Таргетный размер вставки
~500 п.о.
350 п.о. or 550 п.о. 350 п.о. or 550 п.о.
Для исследования каких видов подходит
Любые виды, бактерии, дрозофилы, люди, млекопитающие, мыши, нематоды, растения, крысы, вирусы, дрожжи, данио
Человек, Млекопитающие, Мышь, Другие, Растения, Крыса       Человек, Млекопитающие, Мышь, Другие, Растения, Крыса
Метод Секвенирование ампликоновDe Novo секвенированиеShotgun секвенированиеПолногеномное секвенирование
Генотипирование с помощью секвенированияShotgun секвенированиеПолногеномное секвенирование
Генотипирование с помощью секвенированияShotgun секвенированиеПолногеномное секвенирование
 Специальные типы образцов Кровь, несовместимые с FFPE, слюна
несовместимые с FFPE  Малое количество стартового материала; несовместимые с FFPE

Химия Nextera с транспозомами, присоединёнными к шарикам

nextera-dna-flex-library-prep-kit-web-graphic-1.jpg

(A) Связанные с шариками транспозомы обеспечивают одновременную фрагментацию gDNA и добавление праймеров для секвенирования Illumina. (B) ПЦР-амплификация с сокращённым циклом амплифицирует готовые к секвенированию фрагменты ДНК и добавляет индексы и адаптеры. (C) Готовые к секвенированию фрагменты промываются и пулируются.


Без имени-1.png
Nextera Flex - новая эра пробоподготовки
Откройте для себя все возможности, которые технология Nextera может дать Вашей лаборатории, с помощью этой интерактивной инфографики.
Наборы пробоподготовки Nextera подходят для полногеномного секвенирования в различных областях применения на разных секвенаторах Illumina.
Подробнее